原理和程序 MethylFlash? 羥甲基化 DNA 定量試劑盒(比色法)包含了對(duì)整體 DNA 羥甲基化進(jìn)行比色定量所需的所有試劑。在該檢測(cè)中,DNA 結(jié)合到剝離經(jīng)過(guò)專(zhuān)門(mén)處理的孔中,這些孔具有高 DNA 親和力。使用捕獲和檢測(cè)抗體檢測(cè) DNA 的羥甲基化部分,然后通過(guò)在微孔板分光光度計(jì)中讀取 450 nm 處的吸光度,通過(guò)類(lèi)似 ELISA 的反應(yīng)進(jìn)行定量。羥甲基化 DNA 的量與測(cè)得的 OD 強(qiáng)度成正比,這可以通過(guò)試劑盒中包含的兩種不同 DNA 樣品的相對(duì)羥甲基化狀態(tài)公式或使用標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì) 5-羥甲基胞嘧啶 (5-hmC) 的絕/對(duì)定量進(jìn)行計(jì)算。
簡(jiǎn)單、快速、靈活 整個(gè)比色測(cè)定具有易于遵循的步驟,方便快捷,可在 3 小時(shí) 45 分鐘內(nèi)完成。條孔微孔板規(guī)格允許在手動(dòng)或高通量分析中進(jìn)行靈活的分析。試劑盒包含通用陽(yáng)性和陰性對(duì)照,用于定量來(lái)自任何物種(如哺乳動(dòng)物、植物、真菌、細(xì)菌和病毒)的羥甲基化 DNA。
安/全方便 定量整體 DNA 羥甲基化所需的所有試劑,包括陰性對(duì)照和陽(yáng)性對(duì)照,都方便地包裝在試劑盒中。DNA 樣品的直接比色定量取代了過(guò)時(shí)或劣質(zhì)的方法,無(wú)需 DNA 消化/變性、放射性、提取或色譜分析。
高靈敏度和特異性 新穎的程序和專(zhuān)有的試劑盒組成能夠以高靈敏度和特異性實(shí)現(xiàn)羥甲基化 DNA 的準(zhǔn)確定量。起始 DNA 的檢測(cè)限可低至 40 pg 的羥甲基化 DNA,動(dòng)態(tài)范圍為 40 pg 至 20 ng(見(jiàn)圖 2)。分析靈敏度比 HPLC 高約 10 倍(0.008% 對(duì) 0.08%)。與甲基胞嘧啶和未甲基化的胞嘧啶沒(méi)有交叉反應(yīng)性,因此僅檢測(cè)到羥甲基化 DNA (5-hmC)(見(jiàn)圖 3)。
反應(yīng)靈敏、可靠且實(shí)用 基于其工作原理和微孔板形式,該試劑盒可實(shí)際和常規(guī)地用于各種形式的任何物種,包括培養(yǎng)細(xì)胞、新鮮和冷凍組織、石蠟包埋組織、血漿/血清樣品和體液樣品。為了證明該試劑盒的功能,它已成功用于定量小鼠大腦和 HeLa 細(xì)胞 DNA 中 5-hmC 的含量。MethylFlash? 試劑盒測(cè)得的 5-hmC 百分比與 HPLC 和 LC-MS 方法檢測(cè)的百分比平行且相當(dāng)(參見(jiàn)表 1)。通過(guò)使用該試劑盒,首/次在正常人腦和結(jié)腸組織中發(fā)現(xiàn)了高豐度的 5-hmC。此外,它表明 5-hmC 分別占正常人腦和結(jié)腸組織中總甲基化胞嘧啶(5-mC 加 5-hmC)的 32% 和 16%(見(jiàn)表 2)。相比之下,結(jié)腸癌細(xì)胞系 (HCT116) 和宮頸癌細(xì)胞系 (HeLa) 中的 5-hmC 較低或不存在(參見(jiàn)圖 4A 和 4B)。
表 1.MethylFlash? 羥甲基化 DNA 定量試劑盒與基于色譜法檢測(cè) 5-羥甲基胞嘧啶的方法的比較,以兩種 DNA 樣品類(lèi)型中存在的 5-hmC 的百分比表示。
1Munzel M 等人:Angewandte Chemie,122:ePub,2010 年
表 2.分別用 MethylFlash? 羥甲基化 DNA 定量試劑盒和 MethylFlash? 甲基化 DNA 定量試劑盒測(cè)量不同組織/細(xì)胞中 5-hmC 和 5-mC 的百分比。
圖 4.證明人腦和結(jié)腸組織中 5-羥甲基胞嘧啶豐度高。將 200 ng 從不同組織或細(xì)胞中分離的 DNA 加入檢測(cè)孔中,并使用 MethylFlash? 羥甲基化 DNA 定量試劑盒測(cè)量 DNA 的羥甲基化部分。A: 在各種 DNA 樣品中測(cè)量的 OD 強(qiáng)度。B:各種組織和細(xì)胞中羥甲基化 DNA 的百分比。
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